EBP计划两年前第一次提出对地球上所有真核生物进行测序

在近日由史密森尼生物多样性基因组学项目组与中国华大基因共同主办的生物基因组学大会闭幕论坛上，美国加州大学戴维斯分校的基因组学家 等人与由华大基因生物学家张国杰等人，与世界各地的科学家合作启动了另一个类似于人类基因组计划（HGP）的项目——地球生物基因组计划（EBP），以研究地球上所有的真核生物。 执行测序。

据《科学》杂志官网介绍，EBP计划大约在两年前首次提出，将重点对真核生物群体进行测序，包括所有植物、动物和单细胞生物。 该倡议团队估计，得益于测序技术的进步和成本的下降，可能只需要10年和相当于HGP（约27亿美元）的成本即可完成所有真核生物的测序。

现有的EBP框架大约分三步完成：第一步是为9000个真核生物家族中的每一个家族选择一个代表进行DNA测序，得到的参考基因组应该相当于或优于人类基因组； 第二步是从150,000到200,000个真核属中各选择一个物种进行测序。 详细程度不需要满足第一步的标准。 第三步，对150万个真核物种进行粗略测序。

项目倡导者表示真核生物，EBP已经有了一个良好的开端，多个测序项目已经启动，包括对10000个脊椎动物物种进行基因组测序的 10K项目、破译5000个节肢动物物种基因组的i5K项目、以及对10000个节肢动物基因组进行测序的i5K项目。破译 5,000 种节肢动物的基因组。 基因组测序等B10K项目。“我们要把EBP打造成‘战斗机中的战斗机’。”莱文说。

会上，中国华大基因、英国惠康信托桑格研究所等基因组领先企业表达了积极参与的立场。 然而，EBP项目仍面临重大挑战：一是由于生物多样性问题，只有更多发展中国家的参与和更多的国际合作才能使该项目最终成型； 二是制定生物样本高质量测序和保存标准。 其中，由于现有博物馆动植物样品的保存方法不符合要求，或者需要大量的野外样品，这可能会非常昂贵。